MINT A MOLECULAR INTERACTION DATABASE

Uno degli obbiettivi della “medicina molecolare” è la progettazione razionale di strategie per interferire con la rete di interazioni che è stata alterata nella cellula “malata”. Il raggiungimento di questo obbiettivo è reso difficile dalla nostra relativa ignoranza della complessa ed intricata rete di interazioni tra proteine che è alla base della fisiologia della cellula. Si vorrebbe essere in grado di prevedere come la perturbazione del livello di attività di ogni particolare combinazione di geni, o dell’ambiente nel quale la cellula vive, influenza la fisiologia della cellula stessa. Si è però recentemente compreso che la relazione tra geni e fisiologia o patologia è complicata dal fatto che i piu di 30000 geni presenti nel genoma umano interagiscono in maniera complicata per cui è difficile comprendere, senza l’ausilio di metodi informatici, l’effetto della loro azione combinata. Un passo intermedio per raggiungere questo obbiettivo è la comprensione della mappa di interazione tra tutte le proteine codificate dal genoma umano. In questo contesto abbiamo progettato un “database” informatico che mira a contenere tutte le interazione tra proteine descritte nella letteratura scientifica e a renderle diponibili attraverso Internet alla comunita dei ricercatori. Questo progetto e iniziato come una collaborazione tra il nostro gruppo e gli studenti del corso di dottorato in Biologia Cellulare e Molecolare di Tor Vergata. Stiamo ora cercando di convincere i gruppi della comunita scientifica italiana a partecipare in questo progetto per quamto riguarda i temi di loro specifica competenza. Il successo di questa strategia mettera a disposizione dei ricercatori in biologia e medicina molecolare uno strumento unico per progettare ed interpretare i loro esperimenti.