Sbilanciamento dei deossinucleotidi, conservazione del DNA mitocondriale e malattie mitocondriali
- 3 Anni 2005/2008
- 266.500€ Totale Fondi
Nelle cellule in divisione la sintesi del DNA nucleare richiede precursori (i dNTP) prodotti nel citoplasma dalla via detta "de novo". Il DNA mitocondriale (mt) invece si replica anche nelle cellule differenziate in cui la sintesi de novo é spenta e i dNTP sono prodotti nei mitocondri da enzimi codificati da geni nucleari. Mutazioni in alcuni di questi geni destabilizzano il DNA mt, probabilmente per carenza di dNTP mt. Altre anomalie nella conservazione del DNA mt sono associate a difetti genetici in enzimi che degradano i dNTP nel citoplasma. In questo caso i mitocondri soffrirebbero di un eccesso di dNTP. I meccanismi per cui queste deficienze enzimatiche destabilizzano il DNA mt erano finora largamente ipotetici, in mancanza di metodi per studiare separatamente i dNTP nei mitocondri e nel resto della cellula. In una ricerca finanziata da Telethon, il nostro gruppo ha ideato e convalidato un metodo per distinguere il comportamento dei dNTP mt e citoplasmatici. Lo applicheremo allo studio delle anomalie causate da mutazioni delle due deossinucleoside chinasi mitocondriali, la TK2 e la dGK, e in due enzimi degradativi citoplasmatici, la timidina fosforilasi (TP) e la fosforilasi dei nucleosidi purinici (PNP). Tutte queste mutazioni causano gravi malattie mt umane: sindromi da deplezione del DNA mt (mutazioni in TK2 o dGK), MNGIE (TP) e immunodeficienza delle cellule T (PNP). Per bloccare la funzione di tali enzimi in cellule in coltura e mimare le mutazioni geniche presenti nei pazienti useremo la tecnica dell'interferenza con RNA. Con lo stesso sistema inattiveremo altre proteine implicate nel metabolismo dei dNTP mt. Scopo del nostro lavoro é ottenere un quadro dettagliato della normale regolazione dei dNTP mt e di come la deficienza di singoli enzimi possa destabilizzare il DNA mt e causare la malattia mt. I nostri studi potranno fornire metodi diagnostici per riconoscere le basi molecolari di malattie mt ancora non spiegate e suggerirne il trattamento.
Pubblicazioni Scientifiche
- 2007 JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
Mitochondrial thymidine kinase and the enzymatic network regulating thymidine triphosphate pools in cultured human cells
- 2008 PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AME
Ribonucleotide reduction is a cytosolic process in mammalian cells independently of DNA damage
- 2007 BIOCHEMISTRY
Crystal structures of human and murine deoxyribonucleotidases: Insights into recognition of substrates and nucleotide analogues
- 2006 BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS
Bromovinyl-deoxyuridine: A selective substrate for mitochondrial thymidine kinase in cell extracts
- 2009 FEBS Journal
Unchanged thymidine triphosphate pools and thymidine metabolism in two lines of thymidine kinase 2-mutated fibroblasts
- 2007 JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
Crystal structure of human cytosolic 5 '-nucleotidase II - Insights into allosteric regulation and substrate recognition
- 2006 PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AME
Mitochondrial deoxynucleotide pool sizes in mouse liver and evidence for a transport mechanism for thymidine monophosphate
- 2007 JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
p53R2-dependent ribonucleotide reduction provides Deoxyribonucleotides in quiescent human fibroblasts in the absence of induced DNA damage
- 2008 JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
Metabolic interrelations within guanine deoxynucleotide pools for mitochondrial and nuclear DNA maintenance