Un progetto bioinformatico multicentrico per l’analisi sistematica dei geni espressi nel muscolo scheletrico

La sequenza del genoma umano sta progressivamente diventando disponibile alla comunità scientifica, con un grande impatto sulla ricerca biomedica. Ma la prontezza con cui queste conoscenze saranno tradotte in utili applicazioni dipenderà in gran parte dalla nostra abilità di capire la funzione dei diversi geni in condizioni normali e patologiche. La bioinformatica ha un ruolo centrale in questo campo emergente della genomica funzionale. E l'obiettivo di questo progetto multicentrico è di unire le competenze in bioinformatica sviluppate dai tre gruppi che partecipano al progetto, che si complementano tra loro, con lo scopo finale di contribuire ad una migliore comprensione dei geni espressi nel muscolo scheletrico in condizioni normali e patologiche. Questo progetto è basato sul database muscle-TRAIT (http://muscle.cribi.unipd.it) che è stato sviluppato al Centro di Biotecnologia del CRIBI, Università di Padova con un finanziamento della Fondazione Telethon. Questo database è una collezione di informazioni correlate ad oltre 5000 geni espressi nel muscolo scheletrico umano. Con questa ricerca si vogliono indagare diversi aspetti funzionali di questi geni, a diversi livelli: a livello genomico il lavoro di ricerca sarà focalizzato sui promotori che regolano l'espressione genica; a livello dell'RNA messaggero saranno cercati motivi funzionali nelle regioni non tradotte; a livello proteico saranno studiate le possibilità di interazione proteina-proteina.